自考中每一专业唯一对应一个主考院校，但也有个别专业，专科段和独立本科段是由不同的学校来主考的，把所学专业全部通过并经过毕业论文答辩合格后就颁发主考院校的毕业证书，但并不等于只有主考院校能开设这个专业的学习，只要具有高等教育资质的学校，经当地省考委批准后可开设由其他学校主考的专业。
自考主考学校，是由省考委遴选专业师资力量较强的全日制普通高等学校担任。主考学校在高等教育自学考试工作上接受省考委的领导，参与制订专业考试计划和课程考试大纲，参与命题和评卷，负责有关实践性学习环节的考核，在毕业证书副署，办理省考委交办的其他有关工作。
自考大学遍布全国31个省份，自学考试有山东大学、聊城大学、青岛科技大学、浙江科技学院、浙江大学、嘉兴学院、浙江中医学院、宁波大学、浙江财经学院、杭州师范学院、浙江工业大学、华南理工大学、华南师范大学、暨南大学、华南农业大学、深圳大学、南方医科大学等学校。
自考本科、专科的学校有很多，自考选择的省份不同，院校选择性也就不同。自考的主考学校，是由省（市）考委遴选专业师资力量较强的全日制普通高等学校担任，所以每个省能考的学校是不一样的。其次，自考中每一专业对应唯一一个主考院校，所以只能根据所学的专业选择学校。自考的含金量和学校没有关系，但是自考的难度属实是和学校有关。
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