独立本科和本科都是本科，毕业证的含金量是一样的，不存在哪个更好一点。两者的根本区别在于，本科是要相关专业考生考的，不需要增考。
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而独立本科是自考专门为了跨专业的考生开设的，也就是说不是本专业的学生，想要同时拿到另一专业的文凭，那么需要加考2至3门的相关专业课程。
另外，独立本科段只能由专科生及以上学历的学生报考，而本科段是没有限制的，高中及以上学历都可以报考。
自学考试中的独立本科段是专科层次起点基础上又独立于专科层次的自学考试专业类型，这类专业与同专业的专科没有直接的衔接关系，是为已经取得专科学历的人继续学习而设置的。
本科是指按照普通高等学校的要求而设置的本科专业，它包括基础科段和本科段两段。本科段是本科专业的一部分，与其基础科段有直接的衔接关系。本科段也接受已经取得专科学历的人继续学习。
参加独立本科段和本科专业学习的人。最终均可获得本科学历，符合相关要求者，还可申请并获得学士学位。
一、本科段和独立本科段的区别：
本科段是本科专业的一部分，与其基础科段有直接的衔接关系。而独立本科段是在专科层次起点基础上又独立于专科层次的自学考试专业类型，这类专业与同专业的专科没有直接的衔接的关系。
实际上本科段意思就是和这个专业的大专课程相互衔接的。一般来说，这一类专业如果你不是该专业大专毕业的话，可能学起来会比较吃力，因为他的许多课程都跟大专(在本科段的专业中，其大专阶段会称为基础科段)有关联，假定你已达到了这个专业的大专水平;而独立本科段是指大专和本科相互独立，没有衔接关系，如果直接开始学习的话相对困难会小一些。
二、考生在达到规定的毕业要求后，也都可获得本科毕业证书，符合相关要求者，还可申请并获得学士学位。
两类专业都是专科起点专业，也都是持有国家承认学历的专科(或专科以上)毕业证书或正在专科(或专科以上)就读者才可报考。考生在达到规定的毕业要求后，也都可获得本科毕业证书，符合相关要求者，还可申请并获得学士学位。
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